Besættelsesmuseet fortæller om Aarhus under Anden Verdenskrig, 1940-45. Museet handler om mennesker og om de svære beslutninger, som mange måtte træffe for at klare sig igennem krigen. Det handler om helt almindelige aarhusianere, om de tyske soldater og om Gestapos bødler og deres ofre. Endelig fortæller udstillingen også om dem, der valgte side og blev frihedskæmpere eller gik i tysk tjeneste. Besættelsesmuseet har til huse i Aarhus’ tidligere politistation, der i krigens sidste år var hovedkvarter for det frygtede, tyske sikkerhedspoliti Gestapo.